宏转录组(Metatranscriptomics)是指从整体水平上研究特定环境、特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律,它以生态环境中的全部 RNA 为研究对象,从转录水平上分析微生物群落中活跃菌种的组成以及活跃基因的表达情况。宏转录组测序研究避开了微生物分类培养的过程,扩展了微生物资源的利用空间,为微生物的转录研究提供了有效工具。相较于宏基因组,宏转录组能从转录水平研究复杂微生物群落变化,能更好的挖掘潜在的新基因。
技术路线
技术参数
服务名称 |
测序策略 |
推荐数据量 |
测序周期 |
宏转录组 |
HiSeq PE150 |
一般深度:5G data |
40个工作日 |
样品要求
1. 请提供浓度≥ 100ng/μL,总量≥10μg的RNA(单次建库用量为5μg)
2. OD260/ 280介于1.8 ~ 2.2 之间 ,OD260/230≥1.8~2.0,RIN≥6.5,确保RNA无降解
3. 送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封
4. 样品保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输