长链非编码RNA(long non-coding RNA)是一类长度大于200bp,不编码蛋白的RNA,通过与DNA、其他RNA及蛋白质结合的形式参与到表观遗传、转录调控及转录后调控等生物学过程中。LncRNA测序通过去rRNA法构建文库,通过新一代高通量测序技术获得样本的几乎所有转录产物序列,再结合生物信息学分析鉴定已知lncRNA,并预测新的lncRNA及其靶标。
技术路线
技术参数
服务名称 |
测序策略 |
推荐数据量 |
测序周期 |
LncRNA测序 |
HiSeq PE150 |
12-24Gb clean data |
50个工作日 |
样品要求
1. 总RNA量 ≥ 5µg,浓度 ≥ 150ng/μL。
2. OD260/OD280在1.8-2.0之间,RNA无降解、28S和18S核糖体RNA条带非常亮且清晰(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),28S的密度大约是18S的2倍;Aglient 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN ≥ 8;无蛋白质、基因组DNA污染,如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。