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Small RNA测序

Small RNA是一类长度在20~30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等。作为一类重要的调节因子,Small RNA主要通过诱导基因沉默来调控基因的表达,在细胞的生长、发育、分化、代谢以及个体的生长发育与繁殖等生物学过程中扮演着重要的角色。

第二代高通量测序技术一次性产生上百万条Small RNA序列,能够快速、全面地鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下SmallRNA的表达差异,并可以联合转录组数据进行关联分析,为物种的基因调控机制研究提供有力工具。

 

技术路线



技术参数

服务名称

测序策略

推荐数据量

测序周期

Small RNA测序

HiSeq PE150

10-20M reads

40个工作日

 

样品要求

1. 总RNA量 ≥ 3µg,浓度≥ 50ng/μL。

2. OD260/OD280在1.8-2.0之间,RNA无降解、28S和18S核糖体RNA条带非常亮且清晰(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),28S的密度大约是18S的2倍;Aglient 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN ≥ 8。无蛋白质、基因组DNA污染,如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。
  • 合作伙伴
  • NeoBiolab
  • Abclona
  • Mass Innovation Labs